Суд постановил, что часть наказания осужденные будут отбывать в тюрьме, после чего их переведут в колонию особого режима. Фаридуни проведет первые 18 лет в тюрьме, Мирзоев и Файзов — по 17 лет, Рачаболизода — 16 лет.
Пожизненные сроки также получили ряд пособников террористов. Среди них — Умеджон Солиев, которому назначено пожизненное лишение свободы с отбыванием первых 12 лет в тюрьме, а также Мустаким Солиев, Шахромджон Гадоев, Зайбудулло Исмоилов, Хусейн Хамидов, Мухаммад Зоир Шарипзода, Якубджони Юсуфзода, Назримада Лутфуллои, Джумахон Курбонов, Хусен Медов и Джабраил Аушев.
Еще нескольким фигурантам назначены длительные сроки лишения свободы. Алишер Касимов получил 22 года и 6 месяцев колонии, а Исроил Исломов и его дети Диловар и Аминчон Исломовы — по 19 лет и 11 месяцев.
Рассмотрение уголовного дела заняло около семи месяцев. Государственный обвинитель настаивал на пожизненном наказании для непосредственных исполнителей теракта, а также для ряда их пособников. Фигурантам предъявлены обвинения в прохождении подготовки для осуществления террористической деятельности, незаконном обороте оружия, участии в деятельности террористической организации и совершении террористического акта.
Судебный процесс проходил в закрытом режиме. Такое решение было принято 4 августа после сообщения ФСБ о возможных провокациях со стороны членов террористических организаций, а также из-за наличия в материалах дела сведений, составляющих государственную тайну. Представители потерпевших выступали за открытое рассмотрение, однако суд счел необходимым закрыть слушания в целях безопасности участников процесса.
