Д.Зиёева илмий фаолиятини 1983 йил Тарих институтида кичик илмий ходимликдан бошлаб, институтнинг илмий ишлар бўйича директор ўринбосари (2000-2005), "XIX-XX аср тарихи" бўлими мудири (1998 йилдан ҳозиргача) каби масъулиятли лавозимларда хизмат қилиб келган. 

Олима 1990 йил "Туркистонда XIX-XX аср бошидаги миллий озодлик ҳаракати тарихшунослиги" мавзусида номзодлик, 1999 йил "1917-1924 йилларда Туркистондаги миллий-озодлик ҳаракатлари ХХ аср тарихшунослигида" мавзуларида докторлик диссертацияларини муваффақиятли ҳимоя қилган.

Олима раҳбарлигида "Ўзбекистон тарихи"нинг V жилди, "Ўзбекистон тарихи хрестоматияси"нинг IV жилди ва бошқа қатор тўпламлар нашр этилган.