D.Ziyoyeva ilmiy faoliyatini 1983 yil Tarix institutida kichik ilmiy xodimlikdan boshlab, institutning ilmiy ishlar bo‘yicha direktor o‘rinbosari (2000-2005), "XIX-XX asr tarixi" bo‘limi mudiri (1998 yildan hozirgacha) kabi mas'uliyatli lavozimlarda xizmat qilib kelgan.
Olima 1990 yil "Turkistonda XIX-XX asr boshidagi milliy ozodlik harakati tarixshunosligi" mavzusida nomzodlik, 1999 yil "1917-1924 yillarda Turkistondagi milliy-ozodlik harakatlari XX asr tarixshunosligida" mavzularida doktorlik dissertatsiyalarini muvaffaqiyatli himoya qilgan.
Olima rahbarligida "O‘zbekiston tarixi"ning V jildi, "O‘zbekiston tarixi xrestomatiyasi"ning IV jildi va boshqa qator to‘plamlar nashr etilgan.
